中國醫學科學院皮膚病研究所1954年創建于北京，直屬中央衛生部領導。1970年從北京遷至江蘇泰州，1984年遷南京現址，并建立皮膚病醫院。1986年設立全國性病防治研究中心，2005年調整為中國疾病預防控制中心性病控制中心、中國疾病預防控制中心麻風病控制中心。
   該院所是我國較早成立的從事皮膚病、性病、麻風病，集臨床、科研、防治和教學為一體的國家級專業機構。為世界衛生組織性傳播疾病預防與控制合作中心、皮膚性病學國家重點學科、博士和碩士學位授予點、國家藥品臨床研究基地、中國微生物菌種保藏管理委員會醫學真菌中心、江蘇省臨床醫學中心、衛生部化妝品皮膚病診斷機構、中國醫學科學院艾滋病研究中心性傳播疾病控制中心、家庭健康國際中國合作中心，同時承擔《中華皮膚科雜志》、《國際皮膚性病學雜志》的編輯和出版任務。
   該院所占地4.04萬平方米，建筑面積3.6萬平方米，主要建筑有門診樓、病房樓、醫技樓、科研樓、教育防治業務樓、SPF級實驗動物中心。醫院編制床位100張，設有20多個臨床、科研科室，年接診病員約60萬人次。300余名在職職工中，高級專家62名，博士生導師9名，碩士生導師23名，享受政府特殊津貼專家17名。50余名專家在國家及省級專業委員會任職?，F有中青年骨干中，多人當選衛生部突出貢獻專家、新世紀百千萬國家級人選、江蘇省“六大高峰”人才和醫學重點人才。