安徽醫科大學第一附屬醫院是安徽省規模較大的綜合性教學醫院，集醫療、教學、科研、預防、康復、急救為一體。前身為上海東南醫學院附屬東南醫院，創辦于1926年。1949年內遷至安徽懷遠縣，1952年遷至合肥市。1993年成為衛生部首批三級甲等醫院。2011年進入中國較佳醫院80強排行榜。

   醫院擁有博士生導師51人，副高職稱以上專家660余人，博士和在讀博士200余人，碩士380余人，享受國務院和省政府特殊津貼120人，擔任省級以上醫學學術團體負責人60多人，有7人入選全國"百千萬人才工程"，6人被國家人事部、衛生部授予“有突出貢獻的中青年專家”，省廳以上跨世紀學術技術帶頭人、骨干教師100余人，人才實力位居安徽省醫療機構第一。

   醫院堅持科教興院戰略，學科技術水平不斷取得新的突破，銀屑病的遺傳學研究和紅斑狼瘡基因研究處于國際領先水平，同種異體肝臟移植、自體干細胞移植、異體干細胞移植、異體腎臟移植、體外循環、心臟不停跳冠脈搭橋、心腦血管介入治療、胸腔鏡和腹腔鏡微創手術、輔助生殖技術、小兒腦癱治療等專業技術水平處國內先進水平。在中西醫結合治療大面積燒傷、微粒皮移植、眼角膜移植、人工晶體植入術等方面積累了豐富的經驗,處省內領先地位。

   醫院是衛生部心血管疾病介入診療培訓基地、衛生部腹膜透析培訓示范中心、衛生部臨床藥師培訓基地、衛生部腦卒中篩查培訓基地、衛生部全科醫師培訓基地、衛生部四級婦科內鏡手術培訓基地培育單位。臨床醫學為國家級特色專業建設點，省級教學團隊2個，4人獲安徽省教育名師獎。醫院每年承擔國家級和省級繼續教育項目50余項，培訓學員萬余人。
近年來，醫院承擔國家863計劃和973計劃、國家自然科學基金、安徽省自然科學基金等科研課題200余項，獲省部級以上獎項55余項，其中獲國家科技進步二等獎1項，教育部自然科學一等獎1項，連續兩年獲中華醫學科技一等獎。每年發表學術論文1100余篇，其中SCI收錄論文120余篇，主編和參編國家級規劃教材20余部。主辦5種國內外公開發行雜志：《肝膽外科雜志》、《臨床骨科雜志》、《臨床眼科雜志》、《臨床護理雜志》、《臨床肺科雜志》。醫院與美國、荷蘭、德國、日本、香港等國家和地區的科學研究機構建立了密切的科研合作關系。